Trouvé le problème aujourd'hui, apparement ça vient du câble que j'utilisais entre le compteur et le PITinfo.

A n'y rien comprendre, mais j'avais démonté le Pi zero et relié les RX et TX pour faire un test du port série en loopback et c'était OK, j'en ai donc déduit que c'était soit le PITinfo, soit le câble, soit le compteur.

J'ai commencé par tester le câble en le remplaçant par un autre et ça marche nickel.